利用相似致病菌中保守的致病菌特有基因预测新的毒力相关基因

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目的:在致病机制相似的致病菌中寻找保守的致病菌特有基因,预测新的毒力相关基因.方法:首先选取致病机制相似的致病菌EHEC与EPEC,利用本实验室构建的包含115 152条致病菌特有基因片段的数据库进行本地Blast,得到致病菌特有基因,对致病菌特有基因在相似致病菌中的保守性进行分析,得到新的可能的毒力相关基因.结果:在6株EHEC菌中找到95条保守的致病菌特有基因,其中大部分为已知的毒力相关基因,还有许多可能的毒力相关基因;在9株相似致病菌(EHEC、EPEC)中找到10条保守的致病菌特有的蛋白基因,其中9条为已知的致病相关基因,1条为可能的致病相关基因.结论:应用本方法可以发现新的毒力基因,为后续对致病菌致病机制的实验研究奠定了基础.
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