巴西橡胶树LIM结构域基因克隆与生物信息学分析

来源 :热带生物学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：omlieo

【摘要】

：

根据乙烯利刺激巴西橡胶树（Hevea brasiliensis）胶乳差异表达cDNA文库的EST序列信息，利用RACE技术从胶乳中成功克隆了1个含有LIM结构域的未知功能新基因HbLIM的全长cDNA。生物信

【作者】

：

吴瑞朱家红张全琪张治礼

【机构】

：

海南大学农学院,中国热带农业科学院热带作物生物技术研究所,海南省农业科学院

【出处】

：

热带生物学报

【发表日期】

：

2010年1期

【关键词】

：

巴西橡胶树基因克隆 LIM基因生物信息学 Hevea brasiliensis Gene cloning LIM gene bioinformatical

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根据乙烯利刺激巴西橡胶树（Hevea brasiliensis）胶乳差异表达cDNA文库的EST序列信息，利用RACE技术从胶乳中成功克隆了1个含有LIM结构域的未知功能新基因HbLIM的全长cDNA。生物信息学分析表明，该基因全长cDNA由1016bp的碱基组成，拥有1个570bp的开放阅读框编码189个氨基酸残基；推测氨基酸序列富含Lys，Ser，Ala和Leu，含有2个LIM结构域和2个N-豆蔻酰化位置。序列相似性分析表明，HbLIM编码的氨基酸序列与蓖麻、杨毛、葡萄相应的LIM基因的相似性高达98

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