恒河猴卵巢组织中年龄相关性差异基因的生物信息学分析

来源 :郑州大学学报(医学版) | 被引量 : 0次 | 上传用户:xinqing101
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目的:探索恒河猴卵巢组织中受年龄影响的潜在生物标志物和信号通路。方法:从GSE数据库下载基因芯片数据集GSE44533,其中包含9个恒河猴卵巢样品,共3个年龄组[青年组(3~4岁),中年组(7~8岁)和老年组(18~19岁)],每组3个样品。对3组基因表达谱中的差异表达基因进行筛选,并对筛选出的差异表达基因进行GO分析、KEGG信号通路分析,并构建蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPI)。结果与结论:青年组与中年组有253个差异表达基因,中年组与老年组有68个差异表达基因,而青年组与老年组有636个差异表达基因。GO及KEGG分析结果显示,这些差异表达基因部分涉及卵母细胞减数分裂、丙酮酸代谢通路等。青年组与老年组的差异表达基因中,有6个基因(SNRNP200、DDX46、SNRNP35、DAZ2、ELAVL2、RBM46)存在细胞分子交互作用,可以作为此类研究的候选新方向。
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