人类肠道是大量活性细菌群落的天然栖息地,这些细菌与人类健康有着密切的关系。元基因组学增加了对基因含量的理解,同时也了解了这些微生物的功能及遗传多样性。但是对于胃肠道中活性细菌及其功能我们知道的却很少。试验对10个健康志愿者进行了一项转录组学的研究,以揭示肠道中的活性微生物及其在健康状态下的功能。首先,对从每一个样品获得的cDNAs进行454测序。16S转录组的分析阐明了活性微生物的系统发育结构。Lachno-spiraceae,Ruminococcaceae,Bacteroidaceae,Prevotellace-ae,和Rickenellaceae是所检测到的活性菌的主要家族。mRNAs的特征分析揭示了在健康个体中它们一致的功能模式。肠道微生物主要的功能角色是参与碳水化合物代谢,能量生成及细胞成分的合成。相反,例如氨基酸和脂类代谢在转录组中却不能很好的揭示。结果对健康机体复杂肠道微生物的功能提供了新的认识。在这个基于RNA的研究中,也检测了sRNAs,它是原核生物生理学和致病性重要的调控原件。