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为了避免现行税控系统增值税虚假抵扣的发生，一种全新的解决增值税管理的思想，即在线式增值税管理系统，可以作为金税三期工程解决增值税问题的参考。在线式增值税管理系统依托计算机网络系统，采取在线式开票和在线式抵扣的方法，把增值税发票的使用、开票等所有的信息通过网络采集到数据库服务器中，从而进行开票和抵扣。通过数据的集中和传递，把相应的信息直接传递到抵扣方所在税务局，从而方便使用。