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简要介绍了基因表达式程序设计方法的基本原理,利用VC++和C#混合编程方法编制了其求解反问题的实验平台,在分析了传统K表达式求值算法的利弊后给出了一种新的K表达式快速求值算法Kquick,并对其进行时间、空间复杂度分析,结果显示其明显优越于传统算法;在GEP的程序实现上,采用了单指令多数据(SIMD)技术,充分发挥了算法内含的并行性,设计出了基于GEP的PSS系统,PSS将大大有助于进一步的反问题求解研究。