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目的研究重庆市南川地区人乳头瘤病毒(HPV)31 E6基因多态性,为HPV疫苗设计和HPV防治提供依据。方法采用PCR扩增和导流杂交技术检测HPV31阳性患者宫颈脱落细胞HPV31 E6基因,通过测序并与参考序列对比寻找变异位点。使用ProPred-Ⅰserver和ABC pred server分析HPV31 E6蛋白的二级结构并寻找理想的B细胞免疫表位。结果与参考序列HPV31 REF对比,40株HPV31病毒株中,与参考序列E6基因完全一致的病毒株为10株,占25.0%;HPV31 E6基因突变株14