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湖南省儿童医院胎儿与新生儿外科为无陪护病房，开放床位40张，年收治病人1600余例，年手术近1200台次，是国内规模最大及省内唯一的胎儿与新生儿外科病房。在先天性食管闭锁、肠闭锁、胆道闭锁、直肠肛门畸形、先天性膈疝、先天性巨结肠症、新生儿肿瘤、先天性腹裂、巨大脐膨出、骶脊膜膨出及新生儿外科危急症方面的救治能力达国内先进水平，早产低体重儿先天性疾病的手术救治能力达国内领先水平。