肾透明细胞癌相关基因及通路的筛选及生物信息学分析

来源 :现代泌尿外科杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:susan6918
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目的 运用生物信息学方法鉴别肾透明细胞癌( ccRCC)发生发展过程中的潜在靶基因及信号通路.方法 从 GEO网站 下载基因芯片GSE53000的数据集,用R软件识别肾透明细胞癌和正常肾组织之间的差异表达基因,并对差异表达基因进行层 次聚类分析.然后用DAVID网站对差异基因进行基因本体( Gene ontology)分析和KEGG通路富集分析,最后用STRING网站 和Cytoscape软件构建蛋白-蛋白互作( P P I网络,同时从中筛选出最具有意义的模块,并将其中的基因作为枢纽基因.结果 与 正常肾
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