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19世纪,医学微生物学处于萌芽时期,学科发展的主要标志是开展了细菌生理学,陆续发现了大批、多种病原微生物.20世纪,医学微生物学的基础理论不仅有进一步的发展,还结合有关学科的理论和先进技术,提高了诊断、预防及治疗疾病的水平与效果.在这一时期,我国医学微生物学界前辈汤飞凡、黄桢祥、朱既明等与国外学者共同作出了卓越的贡献.