【摘 要】
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目的通过对重庆市2011-2016年分离的风疹病毒进行基因型别鉴定及系统进化分析,为预防和控制风疹提供分子流行病学依据。方法收集重庆市2011-2016年风疹病毒核酸检测阳性病原
【机 构】
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重庆市疾病预防控制中心,中国疾病预防控制中心病毒预防控制所
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目的通过对重庆市2011-2016年分离的风疹病毒进行基因型别鉴定及系统进化分析,为预防和控制风疹提供分子流行病学依据。方法收集重庆市2011-2016年风疹病毒核酸检测阳性病原学标本进行病毒分离,通过序列测定鉴定其基因型别;与GenBank中风疹各型别参考毒株及其他省市所获毒株进行进化树构建和遗传距离分析。结果 2011-2013年风疹毒株主要为1E基因型(94/103);2014-2016年主要为2B基因型(50/56),仅2014年有1株2A基因型毒株。重庆株系与其他省市毒株核苷酸同源性1E型为97.63%~99.73%,平均98.90%;2B型为95.77%~99.73%,平均98.30%。系统树上重庆毒株并未与其他省市株系相互隔离。结论重庆市风疹优势基因型近年已经逐渐由1E型替代为2B型。重庆市的风疹病毒基因型在不断变化,优势株与其他省市呈共同进化状态。
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