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为了提高故障检测灵敏度，分析了通常的故障检测中难以兼顾虚警概率和漏检概率的原因和船舶组合导航系统故障检测过程中噪声与故障对检测量的影响。根据船舶组合导航系统故障检测的特点，提出了以模糊逻辑和指数加权平均处理检测量和阈值的故障检测策略，并用实船航行数据仿真。该策略对未知输入等干扰不敏感而对故障敏感，且可根据故障的大小自动调节检测时间的长短。对不易检测的小故障，自动延长检测时间以利用更多的信息从而提高检测的正确率；对于较大的故障，自动缩短检测时间从而减少检测延时和累积误差，起到了自适应检测时间窗的作用。