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胡萝卜YUCCA基因家族鉴定及生物信息学分析
摘要：胡萝卜是重要的根菜类蔬菜之一，根部性状影响最终的产量和品质。YUCCA基因通过介导生长素调控植物根部发育，是生长素合成途径中的关键基因。利用生物信息学方法对胡萝卜YUCCA基因家族成员进行鉴定，对其理化性质、染色体定位、系统进化树、蛋白质的二级和三级结构以及保守基序进行分析。结果表明，在胡萝卜的5条染色体上共鉴定到了14个YUCCA基因家族成员，其大部分基因含有3～4个外显子;该家族编码的蛋白质为富含碱性氨基酸的亲水性蛋白质，氨基酸数量为290～424个，其蛋白质结构主要以α-螺旋和无规则卷曲构成，通过构建系统进化树可将其分为3个亚族，且亚细胞定位结果显示，YUCCA基因家族蛋白质大部分被定位在细胞质中。