SARS-CoV-2 Nsp8基因及蛋白分子特征探讨

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目的 SARS-CoV-2感染不仅引起呼吸系统病变,且可能累及生殖系统及中枢神经系统.本研究探讨SARS-CoV-2 nsp8基因变异、Nsp8蛋白结构与生物学功能及靶向药物,为建立更有效的防控策略奠定基础.方法 采用生物信息学技术和大型生物数据库,分析nsp8基因变异性、Nsp8理化特征、空间结构、抗原表位、生物功能、药物结合靶点等.结果 基于3种28株冠状病毒的nsp8序列构建了进化树;SARS-CoV-2毒株间nsp8基因保守性为99% ~ 100%,与SARS遗传距离较MERS近;Nsp8无信号肽及跨膜区;在体外网织红细胞内半衰期为4h,具有亲水性;获得Nsp8二级和三级结构模型;Nsp8具有线性B细胞和CTL细胞抗原表位、磷酸化及SUMO修饰位点;从DrugBank数据库筛选出可靶向结合Nsp8的四种药物.结论 Nsp8具有典型抗原分子特征,参与病毒复制,且同种不同株nsp8基因高度保守,在病毒致病机制、分型及防治研究中具有应用潜力.在全球亟需新型冠状病毒肺炎特效防治措施的状况下,靶向结合Nsp8的化疗药物具有重要科学意义和应用价值.
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