目的对比野生北柴胡根与根茎中各化学成分含量差异,为进一步明确柴胡药用部位提供科学依据。方法实地考察北京百花山与灵山的北柴胡野生资源,采挖地下部分,区分根与根茎;采用紫外-可见分光光度法测定总黄酮及总皂苷含量,高效液相色谱法测定柴胡皂苷a、c、d的含量,利用SAS 8.2软件对根与根茎中各化学成分进行配对t检验与主成分分析,并以主成分得分进行综合性评价。结果野生北柴胡根与根茎中总黄酮含量无显著性差异;根中总皂苷与柴胡皂苷a、c、d含量显著高于根茎含量,其中根茎中柴胡皂苷a+d含量未达到药典规定标准;主成分分析提取三个特征值:综合型（Z₁）、黄酮型（Z₂）、皂苷型（Z₃）,累计方差贡献率达到97.90%,特征向量构建主成分线性关系为:Y=0.6638Z₁+0.1851Z₂+0.1301Z₃,根与根茎主成分得分之间存在显著性差异（P=0.0022）,且根中平均值高于根茎。结论野生北柴胡根茎中皂苷类成分远低于根,根茎不能药用,只有根才可药用。