【摘 要】
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为分析中国新疆小反刍兽疫病毒(PPRV)毒株分子演变特点和疫情传播路线,从GenBank数据库下载所有国家全部的PPRV F基因全序列,应用DNAStar软件,结合疫情毒株时空分布进行序列
【机 构】
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塔里木大学动物科学学院,华中农业大学动物医学院,新疆生产兵团第十四师一牧场,新疆生产建设兵团第三师红旗农场生产科
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为分析中国新疆小反刍兽疫病毒(PPRV)毒株分子演变特点和疫情传播路线,从GenBank数据库下载所有国家全部的PPRV F基因全序列,应用DNAStar软件,结合疫情毒株时空分布进行序列分析.结果显示,中国新疆PPRV株F基因全序列,与2014年小反刍兽疫情中河南和北京毒株核苷酸的同源性最高,为99.8％～99.9％,与中国西藏3个毒株核苷酸的同源性为97.7％,与中国采用的疫苗株核苷酸同源性为92.9％,核苷酸同源性最低的是肯尼亚毒株,与国外毒株核苷酸同源性最高的是印度毒株.F基因系统进化关系分析显示,中国新疆PPRV株属于基因Ⅳ系.F蛋白氨基酸同源性结果显示,除与科特迪瓦1989年毒株ICV89氨基酸同源性最低外,与其他氨基酸同源性比对结果均与核苷酸的比对结果一致.中国新疆PPRV株存在一定程度的变异,可能是由周边国家传人.
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