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使用一种新的概率图模型——条件随机场对蛋白质二级结构进行预测,并给出了模型的构建、训练以及解码的算法。应用这一模型对一个典型的蛋白质数据集CB513的二级结构进行了预测,并将预测结果与其他方法进行比较,预测准确度有明显的提高。
基于条件随机场进行蛋白质二级结构预测
【摘 要】
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使用一种新的概率图模型——条件随机场对蛋白质二级结构进行预测,并给出了模型的构建、训练以及解码的算法。应用这一模型对一个典型的蛋白质数据集CB513的二级结构进行了预测,并将预测结果与其他方法进行比较,预测准确度有明显的提高。
【机 构】
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华中科技大学控制科学与工程系
【出 处】
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计算机应用研究
【发表日期】
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2009年03期
【基金项目】
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国家自然科学基金资助项目(60373089,60674106,60533010,60703047)
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