行政(事业)单位财务制度与会计制度是公立医院财会制度的参照与根本,公立医院财务制度与会计制度又因行业特点拥有自身特色,但在医改背景下,新《医院财务制度》、《医院会计制度》的实施对公立医院财务管理提出了更高的要求。然而,医院实际财务工作过程中所遇到的一些财务制度与会计制度衔接问题,在现有的制度规定或书籍中难以找到合理的解决办法,文章从两种制度变更的背景、特征和意义出发,阐述新《医院财务制度》和《医院会计制度》所具有的优势,通过对新《医院财务制度》和《医院会计制度》在执行过程中所遇到的若干实务问题进行探讨分析,参考借鉴公立医院日常财务处理经验,寻找财务制度与会计制度在公立医院财务管理中的平衡点、结合点,提出可行的操作建议,为各级各类公立医院提供具体明确的财务处理办法,为促进新医院财会制度的实施提供了建设性的参考思路。