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分别采用单因子试验和正交设计2种方法对影响紫椴ISSR-PCR反应体系的4个因素（Taq酶，Mg^2＋，dNTP，引物）在3个水平上进行优化试验。正交设计选用L^9（3^4）方案，采用直观分析法获得影响因素最佳反应水平。单因子试验分别研究各因素对ISSR-PCR反应的影响情况，找出最佳反应水平。2种方法所得影响因素最佳水平存在差异，通过综合比较与分析，最终建立了紫椴ISSR-PCR的最佳反应体系：在20止的反应体系中，Taq酶1．0U，Mg^2＋ 2．0mmol·L^-1，dNTP0．20mmo