【摘 要】
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针对12株引起凡纳滨对虾急性肝胰腺坏死病(AHPND)的致病性副溶血弧菌,运用多位点测序技术,分析致病菌株的遗传特征。实验选择副溶血弧菌的7个管家基因dnaE、gyrB、recA、dtdS
【机 构】
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上海海洋大学食品学院,上海水产品加工及贮藏工程技术研究中心上海海洋大学,农业部水产品贮藏保鲜质量安全风险评估实验室(上海)上海海洋大学,上海海洋大学食品热加工工程技术研究中心
【基金项目】
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国家自然科学基金(31571917,31671779);上海市科委计划项目(14320502100);上海市科技兴农项目(沪农科攻字2015第4-8号,沪农科攻字2016第1-1号,沪农科推字2017第4-4号);上海市教育委员会科研创新计划(2017-01-07-00-10-E00056);上海市教委曙光计划(15SG48)~~
论文部分内容阅读
针对12株引起凡纳滨对虾急性肝胰腺坏死病(AHPND)的致病性副溶血弧菌,运用多位点测序技术,分析致病菌株的遗传特征。实验选择副溶血弧菌的7个管家基因dnaE、gyrB、recA、dtdS、pntA、pyrC及tnaA,对12株AHPND致病菌扩增测序。将核酸序列上传至PubMLST数据库进行比对后获得每株菌的序列型。收集其他地区AHPND致病性副溶血弧菌的多位点序列分型(MLST)数据,采用eBURSTV3及MEGA5.0软件进行遗传进化分析。结果显示,2014年中国广东分离的AHPND致病株属于一个新序列型ST1710(42、134、99、79、141、41、51),仅与库中ST415及ST975同源性较高。目前,急性肝胰腺坏死致病株的9种ST型可归为2个克隆组和5个单体。经系统发育树进一步分析可知新序列型ST1710与单体ST975遗传关系相近。本研究首次报道中国AHPND分离株的序列型,丰富了PubMLST数据库,并为其遗传进化研究奠定了理论基础。
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