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建立财政科技投入市区联动机制,促进区县创新发展、转型发展,真正发挥区县在创新驱动、转型发展中的主动性和能动性,既是上海科技发展的内在要求,也是上海经济、社会发展的战略需要。文章总结了上海财政科技投入市区联动机制的现状及特点,分析了目前存在的主要问题及瓶颈制约,并就进一步优化上海地方财政科技投入市区联动机制提出了若干对策建议。