近年来,随着国家在公共基础设施与市政工程建设项目方面投资力度的不断扩大,与之相关的工程决算审计工作的重要性也越发显现出来,引起了各级政府部门的广泛关注。作为审计工作的一种形式,工程决算审计工作本身也包括了不容置疑的审计风险,甚至超越了财务收支审计的风险。在审计过程中,我们也发现了一些问题,即合同管理的重要性在一些建设单位中没能引起足够的重视,引发了各种不必要的合同风险。由于施工合同直接关系着工程质量、工程进度与投资效益等的实现情况,因此应该针对不同类型的工程合同采取相应的防范措施,避免合同中出现无效约束力的条款,才能减少不必要的开支,节省国家资金,保证工程质量。合同风险审计是工程决算审计的前提和重要组成部分。本文主要针对各种类型的施工合同中存在的不同风险问题,阐述在工程决算审计过程中如何将其回避,达到既能减少不必要的损失,又能控制工程的投资。