了解广西省龙虎山猕猴粪便标本中的GⅡ.17型诺如病毒的流行情况、基因结构和进化特征。

2015年3月~8月收集400份野生猕猴粪便标本，利用建立好的HISEQ高通量测序技术在粪便标本中发现了GⅡ.17型诺如病毒，命名为GX213。采用反转录-聚合酶链反应(Reverse transcription-polymerase chain reaction, RT-PCR)技术对其进行了序列鉴定、全长扩增和检测研究，并对三个开放阅读框(Open reading frames，ORFs)进行了序列和遗传进化分析。

筛查结果显示阳性率为0.5%(2/400)。诺如病毒GX213毒株基因组全长为7 565 bp(包括PloyA尾)，其基因组分为三个ORFs：ORF1(10~5112nt)、ORF2(5093~6715nt)和ORF3(6715~7494nt)，其中ORF1与ORF2之间重叠20 bp，ORF2和ORF3之间重叠1 bp。GX213病毒株全基因组序列分析显示，其与引起2014年至2015年亚洲部分地区暴发的新型人GⅡ.17型诺如病毒变异株CUHK-NS-613(GenBank ID：KU561248)同源性最高(同源性最高为99.5%)。ORF1和ORF3区核苷酸和氨基酸序列都与CUHK-NS-613同源性最高(分别为99.5%，99.4%；99.5%，99.2%)。ORF2区分析序列发现其与CUHK-NS-491毒株(GenBank ID：KP698928)同源性最高，核苷酸和氨基酸同源性分别为99.4%和99.8%，仅P1.1区发现了一个氨基酸的突变aa₂₄₅P→S。另外，RdRp核苷酸和VP1氨基酸序列进化树分析显示该病毒株与人GⅡ.17型诺如病毒CUHK-NS-613和CUHK-NS-491的进化关系最近，而与首次被发现的猴GⅡ.17型诺如病毒KM1509(GenBank ID：KX356908)次之。

本研究发现的GX213属于2014年至2015年在亚洲地区引起暴发的新型人GⅡ.17型诺如病毒变异株，提示GⅡ.17型诺如病毒为人猕猴共患病毒。