【摘 要】
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为揭示籽粒型和鲜食型大豆基因组间的差异,本研究对2个籽粒大豆品种浙春3号、浙春4号和2个鲜食大豆品种浙鲜豆8号、浙鲜9号进行全基因组重测序,平均测序深度为6X,覆盖度大于9
【机 构】
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浙江省农业科学院作物与核技术利用研究所;
【基金项目】
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浙江省粮食新品种选育重大科技专项(2016C02050-10);浙江省自然科学基金一般项目(LY14C130006)共同资助
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为揭示籽粒型和鲜食型大豆基因组间的差异,本研究对2个籽粒大豆品种浙春3号、浙春4号和2个鲜食大豆品种浙鲜豆8号、浙鲜9号进行全基因组重测序,平均测序深度为6X,覆盖度大于94%。通过与参考基因组比对发现,籽粒大豆平均杂合率12.24%,鲜食大豆平均杂合率10.97%,籽粒型大豆杂合度高于鲜食型。2个籽粒型大豆插入和缺失变异占总变异21.89%,染色体间易位变异占总变异41.04%;而2个鲜食型大豆缺失变异占总变异22.38%,染色体间易位变异占总变异46.15%,籽粒型大豆缺失变异率和染色体间易位变异率均低于鲜食型大豆。研究结果在一定程度上反映了籽粒型大豆和鲜食型大豆在基因组水平的差异,为分子标记辅助选择育种提供了科学依据。
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