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提出了一个基于网格的生物基因序列比对与分析平台BioSA,详细描述了BioSA系统的各个组成模块,通过各个模块的分工与合作,BioSA系统可以给计算密集型基因序列比对提供一个统一与可扩展的计算环境。使用网格平台中的Web Services技术、消息通知机制,序列比较分析与查询匹配也可以实现。BioSA不仅支持系统定义的序列比对和分析,而且支持用户定义的、远程的序列分析。通过对实际序列比对的案例实现,验证了BioSA系统的正确性与高效性。