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目的 对1958-2012年青海省人间鼠疫流行期间自鼠疫患者和尸体中分离的119株鼠疫菌进行病原学研究.方法 采用常规方法和分子生物学技术对鼠疫菌进行病原学研究,同时采用差异区段(DFR)基因分型技术对2004年囊谦县、2009年兴海县人间肺鼠疫暴发疫情进行溯源分析.结果 119株鼠疫菌中,105株属青藏高原型菌株,6株属祁连山型菌株,8株菌具有特殊生化特性;84.03％(100/119)的鼠疫菌具有4个毒力因子(F1+、Pst Ⅰ+、VW+、pgm+).测试的74株菌中,72株(97.30％)为强毒菌;携带大质粒52×106、65×106、92×106的菌株主要分布于海南、海北、海西、玉树、果洛、黄南6个州和湟源县;鼠疫菌DFR基因型以5、8型为主.其中5型占44.54％(53/119),分布于都兰、湟源、玉树、杂多、治多、称多、曲麻莱、玛多、囊谦、祁连等地区;8型占32.77％(39/119),分布于祁连山南北麓、青海湖环湖地区.2004年囊谦县肺鼠疫暴发分离株均为10型;2009年兴海县肺鼠疫暴发分离株(来自鼠疫患者、人尸和牧犬体内)的基因型均为8型.结论 本次试验菌株均具备青藏高原鼠疫病原体特性.菌株溯源分析显示,基于DFR的鼠疫菌基因分型与流行病学调查一致,可用于确定传染源。