【摘 要】
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目的 基于TCGA数据库构建乳腺癌代谢相关预后模型,揭示代谢与乳腺癌预后之间的关系.方法 代谢相关基因从KEGG数据库中获取,limma包用于去筛选TCGA数据库中1109例乳腺癌样本和113例正常对照的代谢相关差异基因,随机抽取70％样本作为训练集,剩余30％样本作为验证集,单因素Cox回归用于筛选预后相关基因,基于glmnet包构建代谢相关预后模型,并通过单因素和多因素Cox回归对模型进行验证.结果 本研究筛选出168个代谢相关差异基因,通过生存过滤及去掉过度拟合的基因后最终13个代谢相关的基因用作预
【机 构】
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深圳大学第一附属医院,深圳市第二人民医院医学影像科 深圳 518035;深圳市第三人民医院放射科;深圳市眼科医院医学影像科;中国医学科学院肿瘤医院深圳医院;深圳大学第一附属医院,深圳市第二人民医院医学
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目的 基于TCGA数据库构建乳腺癌代谢相关预后模型,揭示代谢与乳腺癌预后之间的关系.方法 代谢相关基因从KEGG数据库中获取,limma包用于去筛选TCGA数据库中1109例乳腺癌样本和113例正常对照的代谢相关差异基因,随机抽取70％样本作为训练集,剩余30％样本作为验证集,单因素Cox回归用于筛选预后相关基因,基于glmnet包构建代谢相关预后模型,并通过单因素和多因素Cox回归对模型进行验证.结果 本研究筛选出168个代谢相关差异基因,通过生存过滤及去掉过度拟合的基因后最终13个代谢相关的基因用作预后模型的构建,包括NMNAT2、NT5E、QPRT、UGP2、MTHFD2、TSTA3、TYMP、ALDH2、ALDH1A1、IDO1、IL4I1、INPP1和ENPP6.生存分析显示,高风险组患者生存时间显著长于低风险组(P<0.05).单因素和多因素Cox回归结果表明构建的代谢相关预后模型的风险得分是乳腺癌患者的一个独立预后因素.结论 本研究构建的预后模型揭示了代谢与乳腺癌预后之间的关系,为乳腺癌的诊断及研究提供了一个新的视角.
其他文献
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超高性能混凝土(Ultra High Performance Concrete,UHPC)抗氯离子渗透性能是其重要的耐久性能,采用RCM法研究了水胶比、硅灰掺量、钢纤维掺量与类型、粗骨料掺量对UHPC氯离子迁移系数的影响,得出不同因素对UHPC抗氯离子渗透性能的影响规律.研究结果显示,UHPC氯离子迁移系数随水胶比增加而增大,且随硅灰掺量增加而减小;另外,钢纤维、粗骨料掺入和掺量的增加对UHPC抗氯离子渗透性能有不利影响.综合来看,与普通混凝土相比,无粗骨料和含粗骨料的UHPC均表现出较好的抗氯离子渗透性
为探究双边箱梁在不同参数条件下剪力滞效应的主要影响因素,以云龙湾大桥为依托,通过现场足尺原位试验,在实桥中布设4个测试截面,结合有限元软件ANSYS,建立全桥梁-壳模型进行对比分析.结果表明:剪力滞系数于双边主梁和主梁顶板交接处达到最大.截面的剪力滞系数从双边箱到桥面中心线呈先减小后增大的变化规律,剪力滞系数于桥面中心线处达到极大值.吊索和横梁能有效减小剪力滞系数;偏心荷载作用时,偏心一侧剪力滞系数明显增大,另一侧显著减小.
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为评价粉胶比对SBS沥青胶浆性能的影响,采用动态剪切流变仪、弯曲梁流变仪,对4种不同粉胶比的SBS沥青胶浆的高低温性能进行研究,同时采用新型纤维沥青拉拔仪[1]进行试验,提出失稳拉拔功的概念来反映粉胶比对沥青胶浆和纤维之间黏附性的影响,综合试验结果,确定了SBS沥青胶浆最佳粉胶比.并采用灰色关联分析法研究了温度和粉胶比对SBS沥青胶浆的车辙因子、复数黏度和相位角的影响.结果表明,粉胶比对沥青胶浆的各项性能有着较大的影响,在试验范围内,粉胶比越大,沥青胶浆的高温流变性能和其与纤维之间的黏附性也会更好,综合高
目的 探究抑制KIF14与肝细胞癌SMCC-7721对索拉非尼获得性耐药的关系.方法 采用浓度梯度法建立肝细胞癌索拉非尼耐药细胞系SMCC-7721-SR,后采用CCK-8法、流式细胞仪验证耐药细胞株的耐药性.在人正常肝细胞LO2、肝细胞癌SMCC-7721及其耐药细胞SMCC-7721-SR中,采用qRT-PCR及Western blot法检测KIF14的表达情况.随后使用KIF14特异性的小干扰RNA(siKIF14)敲低KIF14并通过Western blot法检测KIF14的表达;为探究敲低KIF
采用新型铝合金液态模锻制备了Al-Cu合金轮毂,研究了其力学性能、成分分布、显微组织及断裂行为.研究结果表明:轮毂试样中存在多种元素的富集和分布现象,其中Cu偏析较为严重;Al-Cu合金轮毂的显微组织由铸造组织和少量变形组织组成;Al-Cu合金轮毂最佳热处理制度为(530±5)°C,4 h+(535±5)°C,24 h固溶后(155±5)°C,4 h时效;T6和T5-1热处理试样的断口形貌为扁平韧窝,塑性差;T4热处理后的断口形貌显示出完全的回复性;经T4热处理后Al-Cu合金轮毂具有最好的伸长率;Al-
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