生物信息学分析长链非编码RNA在结肠癌中的调控网络

来源 :浙江医学 | 被引量 : 0次 | 上传用户：lsy999

【摘要】

：

目的通过生物信息学方法了解长链非编码RNA(lncRNA)在结肠癌中的分子调控网络。方法利用lncRNA疾病数据库预测并筛选得出与结肠癌相关的lncRNAs作为研究对象;运用Starbase v2

【作者】

：

韩泽平李艳黎毓光吕钰冰何思华何金花

【机构】

：

广州市番禺区中心医院检验科,南方医科大学顺德医院科教科

【出处】

：

浙江医学

【发表日期】

：

2020年16期

【关键词】

：

生物信息学长链非编码RNA 微小RNA 结肠癌调控网络 BioinformaticsLncRNAMiRNAColon cancerRegulatory ne

【基金项目】

：

广州市卫生计生科技项目(20181A011118,20201A010085),广州市番禺区科技计划项目(2018-Z04-59,2017-Z04-18)

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目的通过生物信息学方法了解长链非编码RNA(lncRNA)在结肠癌中的分子调控网络。方法利用lncRNA疾病数据库预测并筛选得出与结肠癌相关的lncRNAs作为研究对象;运用Starbase v2.0软件预测与lncRNAs相互调控的miRNAs,并利用HMDD v2.0数据库筛选出与结肠癌相关的miRNAs。进一步利用Consite转录因子数据库分别预测出各lncRNA和miRNA的转录因子并各自取交集后筛选出与结肠癌相关的转录因子。运用miRwalk在线软件分别预测各miRNA的靶mRNA,用一致法筛

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