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有效波高是描述海况的重要参量之一，利用高度计遥感获取有效波高已在海洋研究中获得广泛应用。本文基于海洋二号（HY-2）卫星高度计波形数据，发展了一种高分辨率有效波高反演算法，采用中误差对反演得到的20 Hz有效波高进行筛选，有效提高了测量精度。通过该方法对1个轨的波形数据进行有效波高反演，统计结果表明：与针对1s回波反演的有效波高比较，利用该方法可将有效波高观测分辨率提高约15倍，精度约为0.44 m；利用HY-2高度计20 Hz波形数据反演的有效波高精度可靠，可用其进行高分辨率的相关海洋研究。