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为揭示黔产薯蓣属植物9个种之间的亲缘关系，根据叶绿体matK、rbcL、psbA-trnH序列片段对其进行种间分子鉴别研究。结果表明，黔产薯蓣属植物9个种的matK、rbcL、psbA-trnH序列长度分别为1 076~1 141 bp、361~382 bp、1 160~1 209 bp，当空位始终作缺失处理时，其变异位点分别占序列总长度的14.3%、7.8%及8.7%。系统进化显示，来自9个种31份样本的薯蓣属植物分为了4个大组。其中，黄独单独为一组，为基生翅组；黑珠芽薯蓣和高山薯蓣聚为一组，为复叶组；