【摘 要】
:
通过生物信息学方法筛选出与林奇综合征相关结直肠癌(colorectal cance,CRC)组织中的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)。从基因表达总库(gene expression omnibus,GEO)下载林奇综合征相关CRC数据集GSE178516,使用GEO2R筛选DEGs,并在人类疾病数据库Malacards中获取CRC和林奇综合征疾
【基金项目】
:
国家自然科学基金青年项目(82003002); 福建省引导项目(2021Y0061); 福建医科大学科研发展基金项目(2021QH1322);
论文部分内容阅读
通过生物信息学方法筛选出与林奇综合征相关结直肠癌(colorectal cance,CRC)组织中的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)。从基因表达总库(gene expression omnibus,GEO)下载林奇综合征相关CRC数据集GSE178516,使用GEO2R筛选DEGs,并在人类疾病数据库Malacards中获取CRC和林奇综合征疾病基因,3者的交集取为关键Hub基因,通过功能富集分析鉴定DEGs。利用String数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用网络(protein-protein interaction,PPI),并使用Cytoscape软件对PPI网络进行可视化和模块分析。随后在easyGEO数据库中对差异表达基因进行表达验证。从GSE178516共鉴定出261个差异基因,包括117个上调基因和114个下调基因。这些基因与CRC和林奇综合征基因共交集出8个差异表达基因(TGFBR2、PTEN、POLD1、EXO1、EPCAM、CDKN2B、CCND1、BRCA1)。GO、KEGG富集分析显示,其功能主要富集在DNA代谢过程调控、内在凋亡信号通路、错配修复等方面;KEGG通路分析主要富集在CRC等相关癌症路径。通过PPI获得与67个差异表达蛋白存在相互作用关系的892个蛋白,并利用Cytoscape软件构建其重要模块,包含44个节点和630个节点作用关系。利用easyGEO网站对8个差异基因进行表达分析,发现8个基因在林奇综合征相关CRC患者中的表达均具有统计学差异。总体上,研究鉴定出的关键Hub基因有助于了解林奇综合征相关CRC发生和发展的分子机制,并为林奇综合征进展对CRC的诊断和治疗提供新的候选靶点。
其他文献
在疫情反复之下,强身健体增强免疫力成为刚需。伴随2022冬奥会刮起了一股冰雪运动的热潮,滑雪服,冲锋衣等运动服装需求量也大增。在中国,纺织服装行业,因为人口红利逐渐消失,加工成本增高,款式简单且大数量订单已经从国内转移到东南亚国家。YT公司是瑞士体育用品采购总部驻深圳办事处,负责服装、鞋类和健身器械在东南亚供应商处的采购。2018年以后,YT公司服装采购战略重心从中国转移至东南亚其它国家,导致YT
汽车产业是经济发展和壮大的重要组成部分,产业链涉及的供应链环节非常多,不仅包括汽车零部件供应链,还包括配套零部件供应链,每一个供应链的每一个环节都有数以千计的供应商,因此加强供应商的选择和管理,可以确保汽车产业的健康可持续发展。首先,本文以布雷博公司为研究对象,详细地分析该公司的供应商管理现状,包括供应商的选择、绩效考核与激励、供应商关系管理等,基于问卷调查的结果分析供应商管理存在的问题,调查结果
普及高中阶段教育是当前我国教育改革和教育现代化发展的重大战略,随着普及目标的完成,高中阶段教育质量提升成为急需探讨的问题。教师是教育质量提升的关键因素,在普通高中教育普及过程中,规模的快速增长导致普通高中教师队伍结构不合理。具体表现为数量不足、学历结构偏低、教师队伍年轻化明显。在教师专业发展上存在教师参加高质量培训机会较少,教育信息化对教师专业发展支持力度弱,教师工作量大、激励不足等问题。为此,需
通过在甘肃临夏太子山一带开展1∶5万水系沉积物测量工作,初步查明了研究区1 874 km~2范围水系沉积物的地球化学特征,依据元素组合特征、区域成矿地质背景等圈定综合异常31处,其中见矿异常19处,划分找矿远景区6个,优选找矿靶区10处,结合异常查证,确认大多数异常受岩浆岩和断裂构造控制,区内与酸性侵入岩有关且强度较高、元素组合较好的异常区有利于找矿。通过矿产检查新发现金、铜、铅、锌、锑等金属矿(
“双高计划”对高职院校“双师型”教师队伍建设提出了明确的具体要求及实施计划。在对职业技术教育教师队伍现状分析的基础上,从坚持导向机制、强化激励机制、创新培育机制、优化评价机制等方面,探讨了高职院校“双师型”教师队伍的机制建设问题。
<正>教师是立教之本,兴教之源。高质量教师队伍在加快建设高质量教育体系中发挥着基础性、先导性、牵引性作用。习近平总书记在致全国优秀教师代表的信中,鲜明地指出了中国特有的教育家精神的深刻内涵,为新时代教师队伍建设指明了前进方向。高质量教师队伍建设是各级各类教育高质量发展的关键,也是中国式现代化建设背景下从“教育大国”迈向“教育强国”的必然选择。我国教师队伍高质量建设应紧紧围绕“高质量”要求,在以下三
以习近平新时代中国特色社会主义思想为指导,实施“人才强校”战略,持续推动学校人事人才工作高质量内涵发展。面对新形势、新任务,深入贯彻落实学校第四次党代会精神,树牢“人才是第一资源”理念,凝心聚力,锐意进取,打造一流师资队伍,为建设中国特色国际知名出版大学提供坚实人才保障。
为延长大水金矿的服务年限,解决资源危机,通过对矿区构造叠加晕研究,对其深部找矿潜力和找矿方向进行预测和评价。系统采集矿区69个中段、120个钻孔的岩石、矿石样品进行测试分析,利用多元统计方法,对矿区成矿成晕元素的组合特征和空间分布特征进行分析,并以找矿前景较好的87(B)勘查线为主要研究对象。研究表明:(1)大水金矿主成矿元素Au与伴生元素As、Sb、Hg表现出较好的正相关关系,可作为后期找矿勘查