IDQD算法在大肠杆菌Sigma 70启动子预测中的应用

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启动子是基因转录起始最重要的调控单元。本文在深入分析大肠杆菌启动子区和非启动子区序列结构特征的基础上,利用离散增量结合二次判别分析的方法(IDQD)对大肠杆菌Sigma 70启动子进行预测。利用十折交叉检验,对于编码区负集,平均正确率为87.21%;而对于非编码区负集,平均正确率为86.06%。预测结果表明,该算法对大肠杆菌启动子预测是有效的。
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