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环糊精及其衍生物由于具有一定大小的低极性空腔结构，能够包合多种低极性有机物，形成主客体包合物。这种包合物的形成可以增加有机物的水溶性和促进其被微生物的分解利用；可以改变有机物的物理化学特性，促进其在光化学和芬顿体系中的降解；可以在去除有机物的同时，去除Cd^2＋等无机物；此外，环糊精还可以用来制成环境友好材料，吸除空气和水中污染物。