基于GEO数据库的克罗恩病差异表达基因生物信息学分析

来源 :胃肠病学和肝病学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户：zyr2007

【摘要】

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目的寻找克罗恩病(Crohn’s disease,CD)的差异表达基因,进一步筛选与CD发生相关的潜在靶点,为CD的防治提供新思路。方法从GEO数据库下载GSE83448基因芯片,利用GEO2R在线分析

【作者】

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王嘉源郭远美董卫国

【机构】

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武汉大学人民医院消化内科

【出处】

：

胃肠病学和肝病学杂志

【发表日期】

：

2021年3期

【关键词】

：

炎症性肠病克罗恩病生物信息学分析 GEO数据库 Inflammatory bowel disease Crohn’s disease Bioinformat

【基金项目】

：

国家自然科学基金资助项目(81870392)

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目的寻找克罗恩病(Crohn’s disease,CD)的差异表达基因,进一步筛选与CD发生相关的潜在靶点,为CD的防治提供新思路。方法从GEO数据库下载GSE83448基因芯片,利用GEO2R在线分析工具筛选出CD患者与健康人群肠黏膜组织的差异表达基因(P<0.05,logFC>1.5),并采用GraphPad Prism 8.0.1作图进行可视化展示。使用Metascape在线数据库和String网站对差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)分

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