铁路运输业关系国计民生,具有巨大的公益性,其公益性主要体现在公益性运输,即以低于成本的价格提供社会运输服务。建立适当的铁路公益性运输补贴机制对于发挥铁路的公益性具有极其重要的意义。本文首先通过分析国内外铁路公益性运输补贴机制,总结出交叉补贴与亏损补贴机制、特许经营权与最低补贴竞标机制、固定每单位运价补贴合约与绩效补贴合约等四种具有代表性的铁路公益性运输服务补贴机制。再利用博弈论分析不同补贴机制下参与人的最优反应,分析四种补贴机制在我国的适用性。研究发现,目前实施的交叉补贴与亏损补贴方案效率最低;我国铁路公益性运输在近期内可以采取绩效补贴模式;在中期,采用政府与铁路总公司签订固定每单位运价补贴合同;从长期看,应将竞争机制引入铁路运输行业,调整铁路运输市场结构,对公益性运输业务进行最低补贴招标,让多家铁路运输企业参与特许经营权竞标。