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目的在省、县二级建立适用于消除疟疾背景下的督导与评估指标框架,为考核消除疟疾工作提供依据。方法收集《消除疟疾行动计划(2010-2020)》、《消除疟疾技术方案》、《消除疟疾考核评估方案》等相关资料,在广泛开展专家咨询基础上,建立省、县二级督导评估指标,并在云南省和安徽省试点应用,评价其可及性、可靠性和可操作性。结果研究建立的框架包括了投入、过程、结果和影响4类指标。其中省级指标95项,县级指标98项。云南省和安徽省指标填报完成率分别为94.7%(90/95)和95.8%(91/95);云南省腾冲县和安徽省肥东县2个试点的填报完成率分别为93.9%(92/98)和92.9%(91/98)。结论建立的指标框架可靠性高、可操作性好,能有效反映防治工作进展、及时发现存在问题,可为评估疟疾消除工作成效提供依据。