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甲藻及其它赤潮生物孢囊被认为是赤潮发生的种源,其分布特征是赤潮发生预测的重要依据,本研究对南海大鹏湾赤潮发生密集海区底泥进行了采集分析,在调查的12个站位中,共发现甲藻孢囊29种,针孢藻孢囊1种,其中以锥状斯氏藻为最优势种,多边膝沟藻,褐色原多甲藻和塔马亚历山大藻为优势种,孢囊的水平分布以水深最深的S2和水流最缓的最缓的S4两站位孢囊的种类数量最为丰富,且两站位的卤含量高地其他站位,对孢囊的垂直分