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采用水蒸气蒸馏法从10批水杉种子中提取挥发油，采用气相色谱-质谱联用技术（GC-MS）分析挥发油的主要化学成分及其相对含量，建立水杉种子的GC/MS指纹图谱。结果表明：水杉种子挥发油主要含有8个共有特征峰，各峰的相对保留时间基本一致（RSD＜0.5%），其相关系数（≥94%）、相似度（≥90%）、夹角余弦（≥95%）、相似性比（≥0.89）均达良好水平。本指纹图谱具有较好的特征性，能够反映产地差异情况，可用于水杉种子的质量鉴别。