2005年1月28日，张家港保税物流园区通过国家海关总署等6部门的联合验收，在不到两个月的时间内，通过各方努力，正式封关运作，成为继上海、大连之后的第三家封关运作的保税物流园区。张家港保税物流园区是国内惟一实现“区港一体联动”的“内河港型”保税物流园区，除享受保税区政策外，还叠加了出口加工区政策，入区的出口货物不仅可以直接退税，还可享有货物自由组合、即时配送及存放无时限等国际自由贸易区的功能。保税物流园区于3月21日正式封关运作以来，截至7月底，进出物流园区的货运量达到110万吨，货值为6.8亿美元，海关征收税款超过6亿元人民币，签退出口退税黄单超300份。从目前出口企业的区域来看，共涉及全国7个省市，从货物种类来看包括化工、纺织、钢材、五金、机电等多种领域。
　　
　　国际物流巨头竞相落保
　　
　　张家港保税物流园区以它独特的魅力吸引着许多国际物流巨头竞相来此投资。近段时期，德国瓦克、日本三井等10多个大型物流项目落户张家港保税物流园，投资主体均为国际上赫赫有名的专业物流供应商，还有多个国际物流企业正在与保税区管委会谈判，希望能在区内有一席之地。目前，这种国际上专门从事物流服务的国际采购商和“第三方”物流企业在张家港保税物流园区已有24家，总投资超过40亿元。其中荷兰孚宝公司是全球最大的石化物流供应商，该公司早就看好张家港保税物流园的区位优势和政策优势，不惜下“重注”1.8亿美元抢先在保税物流园区内修建大量的化工品储罐和仓储码头，为争夺张家港客源抢占先机。园区优惠政策对于国际物流配送企业而言，已成为福音。如张家港保税物流园区百科标准件有限公司是全球知名的紧固件采购销售商——荷兰borstlap公司在张家港成立的专业物流公司，百科公司2004年在保税区租赁仓库从事五金标准件的国际配送业务。业务流程是：从国内外企业收购大量标准件后在保税区内通过重新包装、加贴标签等简单增值后，再以自己的品牌销售至境内外。该企业原来通过保税区操作时，由于国内货物出口至保税区时，并不享受退税政策，必须等该批货物全部真正出口至境外后，海关才予以签发退税联。由于货物需质量检验、改换包装及实际离境后仓单数据更改等多种因素，往往需要3个月后，海关才可能对其签批退税联。而目前通过物流园区的运作，国内货物只要出口至园区，企业马上就可以拿到出口黄单，从而加速了资金的周转。随着百科公司业务量的不断发展，预计其全年的业务量要达到近1亿元人民币的出口额，由于货物周转的需要，仓库的储存货值也要达到3 000万元人民币左右。
　　
　　企业物流成本大幅降低
　　
　　在江苏省张家港华芳纺织集团的发展史上，有这样一段经历是不会忘记的。在张家港保税物流园区没有封关运作之前，该集团出口棉纱办理出口退税的过程一般是通过公路运输将货物运抵上海港，再通过海运出口到香港完成出境，办理出口退税手续，货物然后从香港海运回到上海港，再由江阴的公司用手册在上海港通关后，通过公路运输拉回江阴工厂里，所有的物流成本以一个40英尺的集装箱为单位计算在11 000元左右，时间最快也要15天。而张家港保税物流园区封关运作后，由于保税物流园区叠加了保税区和出口加工区的政策，并被赋予口岸功能，其最大的优惠就是国内货物出口至物流园区即可享受出口退税待遇，整个过程物流成本仅为3 000元左右，节约资金达8 000元，每个集装箱节约的物流成本就高达70%，3个月以来该江阴企业通过张家港保税物流园区操作的货物量超过160个集装箱，累计节约费用120余万元。再从物流时间上看，原来的货物通过“香港游”需要15天后才能到达江阴，而通过张家港物流园区操作后，张家港的企业从备货开始仅需2天就能使货物到达目的地。
　　物流成本从11 000元降到3 000元，时间成本从15天缩短到2天，张家港保税物流园区运作，无疑成为企业发展的“加速器”，它不仅给张家港本地企业带来了实惠，也给整个苏南周边地区的企业带来了福音，深受广大企业欢迎。据了解，前不久日本松下电池无锡公司等生产型企业知道了张家港保税物流园区的各种功能后，像发现了“新大陆”似的兴奋。过去由于出口退税政策的限制，像松下、夏普等日资企业通常是将货物生产完毕后通过附近港口出口到日本，然后由日本本土的中心仓库发往其他国家，不仅仓储和运输成本高，进出口环节也十分烦琐。张家港保税物流园区封关运作后，这些货物进入园区即可退税，存储区也可根据需要进行分拆配送，据测算，像松下、夏普这样的公司每月因此至少能省下上百万元费用，发货周期能缩短两天以上。
　　
　　保税区企业锦上添花
　　
　　张家港保税物流园的建立运作不仅使区外企业品尝到降低物流成本的甜头，对于保税区内的生产企业来说，也是获益非浅。其中最突出的好处就是能使原生产出口产品时采用的部分国产料件难以退税的问题得到了妥善的解决。例如张家港保税区泰亿机械有限公司生产的自行车成品全都是出口至境外，但是生产所用的原材料，一部分是属进口料件，還有一部分是国产料件，由于出口报关时只能以加工贸易的方式申报成自行车整车出口，因此，海关签退的退税联也只能是自行车整车出口的出口退税联，不可能对料件再出具出口退税联，而国税部门对其整车中所含有的国产料件的数量、价值很难界定，也就只能对该企业整车加工过程中的增值部分进行退税，从而造成了这一类国产料件的退税难题一直成为保税区许多生产企业的历史困惑，没能得到妥善的解决。而保税物流园区运作后，这一难题就可迎刃而解。保税区企业出口成品所采用的国产料件可以先以供应商的名义以一般贸易方式出口至物流园区，海关即可签发报关单出口退税联给供应商（供应商直接凭海关签发的出口退税专用报关单到当地国税局办理退税），然后再将这部分料件以区区结转的方式，由物流园区结转至保税区内企业的手册上，从而彻底地解决了保税区生产企业出口产品所含国内料件退税难的这一历史遗留问题，使保税区生产企业能够全方位地享受到保税区、保税物流园区的各种优惠政策，进而进一步增强了企业在国际市场的竞争能力。
　　
　　海关为保税区保驾护航
　　
　　为了积极推动园区的健康发展，张家港保税区海关倾注了很多心血，他们一方面加强对外政策的宣传力度，使周边地区企业尽快熟悉相关政策和操作程序。另一方面通过采取提前申报制度、24小时卡口值班制度、加班查验制度等多种手段大力支持企业的进出区业务运作，赢得了许多企业的好评。2005年8月4日正式与杜邦-旭化成聚甲醛（张家港）有限公司、张家港保税区长江国际港务有限公司签订了甲醇出区集中报关的合作备忘录，提出了对杜邦-旭化成公司的进口甲醇实施“分批出区、集中报关”的通关监管模式，既充分体现了海关严密监管与高效服务的有机统一，又实现了海关与企业、政府之间的“多赢”，顺应了国际贸易和现代物流业的发展方向，同时也为张家港保税物流园的未来发展探索新的通关监管模式。
　　2005年以来，张家港保税区海关为了进一步提升对保税物流园的监管水平，还以科技为依托，推进了3个科技系统的改革：一是开发了保税物流园区的物流信息化系统，使货物的报关数据、仓储数据、进出卡口数据得到了有机的共享和相互的制约，从而实现了快速通关与严密监管的高度统一；二是深化完善了液体散化的联网监管，使保税区海关对液体化工品的监管水平走在了南京关区的最前沿；三是建立了液体化工品价格信息平台，使保税物流园进口的化工品交易行情在海关总署估价网上及时得以公布。