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以甘蔗黄叶病毒（ScYLV）特异性引物YLSF111和YLSR462为引物，对福建蔗区8个罹病品种的疑似病株进行RT-PCR检测，扩增出352bp特异性片段．将PCR产物克隆后测序，序列分析表明，该片段是ScYLV外壳蛋白（CP）基因的一部分，核苷酸和氨基酸序列同源性达95％以上，与美国、印度、巴西等国家ScYLV分离物（GeneBank登录号分别为AF157029、AY236971、AF141385）CP基因同源性达100％，证实我国福建地区甘蔗黄叶综合症的病原体为ScYLV．本研究同时建立了ScYLV