吉林省农业科学院果树研究所是以抗寒果树资源、育种和栽培技术研究为主的公益性事业单位。全所占地面积约50公顷。现有在职职工39人，其中高级职称人员8人，中级职称5人，初级职称9人。其中博士3人，硕士9人。设有果树资源研究室、仁果育种研究室、核果育种研究室、浆果育种研究室、果树生物技术研究室、果树栽培研究室。1986建立了“国家果树种质公主岭寒地果树圃”，成为中国国家果树种质16个资源圃之一；它占地近10公顷，保存国内外抗寒果树资源14科、29属、80种共1003份材料，是世界上保存抗寒果树种质资源种类最多的圃地，其中近二分之一被列为国家一类保护资源。2004年建立了寒地果树资源鉴定数据库和寒地果树资源图像数据库，此外，还设有农业部公主岭寒地果树重点野外观测试验站。
　　果树育种主要开展了苹果、梨、葡萄、李、杏、草莓的新品种选育。先后培育出了27个果树新品种，栽植面积占全省果树生产总面积的75%左右。其中梨品种有苹香梨、大梨、大慈梨、寒香梨、寒红梨、早梨18、蔗梨；葡萄品种有甜峰、公酿1号、公酿2号、公主白、公主红；苹果品种有金红（123）、冬红、秋红、元红、公主岭国光、象牙黄、绿香蕉、矮化砧GM-256；草莓品种有公四莓一号、四季公主2号、三公主；李品种有6号李、红星李、桦树晚李，与长春市农科院合作育成紫叶李“北国红”。在农业部实施的产业科技创新体系建设中，梨育种设立了专家岗，葡萄设立了综合试验站；苹果育种和矮化砧木育种、梨育种也参加到国家科技部支撑计划项目中。
　　果树栽培技术研究取得的成果主要有苹果矮化密植栽培技术、葡萄无核化技术、苹果梨密植拉枝早期丰产技术等。
　　经过几代科技人员的艰苦努力，研究所获得了国家科技进步二等奖2项，农业部科技进步一等奖1项、二等奖1项；吉林省科技进步一等奖1项，二等奖3项，三、四等奖7项，丰收计划奖多项。出版著作20余部，发表论文200多篇。成果推广应用面积、产生的社会经济效益：新品种新技术累计推广面积达1051.1万亩，占适宜栽植区域果树面积的75%，创经济效益120亿元。
　　其中代表性成果如下：
　　四季草莓新品种：“公四莓一号”、“四季公主2号”、“三公主”推广1000亩，创经济效益500万元。
　　梨新品种：苹香梨、大梨、大慈梨、蔗梨、早梨18号、寒红梨、寒香梨，推广10万亩，增加经济效益2亿元。大梨和大慈梨获得省科技进步三等奖。
　　苹果梨密植栽培技术：建立了大黑山优质苹果梨基地，获省科技进步二等奖。全省范围内推广苹果梨矮化密植栽培技术30万亩，增加经济效益3亿元。
　　葡萄新品种：公酿一号、公酿2号、甜丰、公主红、公主白，推广10万亩，创经济效益5亿元。
　　葡萄无核化技术：1万余亩，增加经济效益3000万元。甜丰无核化栽培技术获得省科技进步二等奖。
　　苹果新品种：金红（123）、绿香蕉、象牙黄、GM256，累积推广1000万亩，增加经济效益100亿元。其中“金红”苹果是我国建国后人工杂交培育的第一个新品种，也是目前我国具有自主知识产权的商品化种植面积最大的苹果品种，获得了全国科技大会奖。“GM256及其砧穗配套栽培技术”，获得省科技进步二等奖。
　　李杏新品种：六号李、晚红李、“优一”仁用杏，推广10万亩，创经济效益1.5亿元。“李杏地方品种的搜集、筛选和利用研究”，获得省科技进步三等奖。
　　研究所将以农业科技创新为使命，竭诚为农业、农村、农民提供优质服务。