【摘 要】
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目的:预测和分析人颗粒溶素(Granulysin,GNLY)蛋白的结构与功能。方法:采用生物信息学的方法对GNLY进行系统分析与研究,包括GNLY的理化性质、跨膜区和引导肽、亚细胞定位、二
【机 构】
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甘肃省人民医院,武威市人民医院,甘肃省肿瘤医院
【基金项目】
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国家自然科学基金(项目编号:81360344);甘肃省人社厅留学回国人员择优资助项目(项目编号:2012123)
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目的:预测和分析人颗粒溶素(Granulysin,GNLY)蛋白的结构与功能。方法:采用生物信息学的方法对GNLY进行系统分析与研究,包括GNLY的理化性质、跨膜区和引导肽、亚细胞定位、二级结构功能域、蛋白质的功能分类预测、多重序列比对与系统发育树构建、三级结构建模等。结果:GNLY蛋白分子量为15.33k D,等电点为9.35,具有引导肽(N端1-22个氨基酸序列)无跨膜区,该蛋白属于分泌性蛋白;其二级结构主要为α螺旋和无规则卷曲,包含1个Sap B结构域,三级结构显示结果与二级结构预测结果相符。蛋白质多重序列比对和聚类分析显示,人GNLY蛋白与牛、猪及艾鼬等哺乳动物的GNLY蛋白具有一定的同源性。结论:GNLY生物信息学数据的探索,可为GNLY蛋白的功能研究提供参考资料和理论依据。
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