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结合FTIR和电子能谱EDS指纹图谱，鉴别了两种组成相近的中药复方右归丸和济生肾气丸。测定右归丸和济生肾气丸样品氯仿提取物的红外指纹图谱，依据W检验理论判别方法精细建立两种中药复方红外指纹图谱的特征吸收峰组，确定了各个特征吸收峰相对应的特征分子基团和药物成分组成。同时测量两种中药复方原药粉末样品的EDS指纹图谱。根据两种中药复方FITR指纹图谱中的特征峰组及其对应的化合物类型和原药粉末的EDS谱中多种元素的种类和含量信息，可以快速准确鉴别右归丸和济生肾气丸，使红外指纹图谱法达到了与色谱指纹图谱法相似的鉴别