引起大连地区一起儿童急性肠胃炎疫情的诺如病毒基因亚型分析

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目的 了解引起2020年10月大连市西岗区一起儿童急性肠胃炎疫情的诺如病毒基因亚型,为该类疾病的预防和控制提供参考数据.方法 提取患儿粪便标本中的病毒RNA,应用逆转录聚合酶链反应(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)进行诺如病毒特异性核酸片段检测并进行测序,使用 Lasergen 7.1、Norovirus Typing Tool Version 2.0、Clustal X 2.1 和 MEGA 10.1 等软件对毒株的基因序列片段构建Neighor-joining系统进化树并进行种系进化分析.结果 2020年10月大连市西岗区一起儿童急性肠胃炎疫情的11份患儿标本中检出NVGⅡ型核酸阳性,其中1份经RT-PCR扩增并测序后,构建系统进化树分析比对为诺如病毒GⅡ.4亚型Sydney-2012变异株,片段长度为282 bp,核苷酸同源性为98%.结论 引起大连市一起儿童急性肠胃炎疫情的诺如病毒是GⅡ.4亚型Sydney-2012变异株,此亚型也是目前引起儿童急性肠胃炎疫情的主要基因亚型.
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