【摘 要】
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目的探讨GPC5基因在肺腺癌组织和正常肺组织中差异表达和突变情况。方法通过基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)的两个数据集分析肿瘤组织和相匹配正常组织GPC5表
【机 构】
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第三军医大学军事预防医学院军队流行病学教研室; 第三军医大学新桥医院胸外科; 第三军医大学新桥医院全军呼吸内科研究所,全军呼吸病研究重点实验室;
【基金项目】
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国家自然科学基金面上项目(81171903);重庆市自然科学基金(CSTC2011BB5024)~~
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目的探讨GPC5基因在肺腺癌组织和正常肺组织中差异表达和突变情况。方法通过基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)的两个数据集分析肿瘤组织和相匹配正常组织GPC5表达量,对GPC5基因表达差异进行分析。运用肿瘤基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)公共数据库初步分析GPC5突变和拷贝数变异情况。运用实时定量PCR检测39例肺癌患者肿瘤组织和正常组织样本中GPC5基因的表达,对结果进一步验证。结果我们对GEO数据库中的两个数据集进行分析发现肺腺癌肿瘤组织中GPC5表达量明显低于配对的正常组织(P<0.05);实时定量PCR检测结果证实了GPC5基因在肿瘤组织中的相对表达量均显著低于相匹配的正常组织(P<0.01),而且与Ⅰ期肿瘤组织相比,Ⅱ期+Ⅲa期的肿瘤组织中GPC5表达水平明显较低(P<0.05)。结论 GPC5基因的拷贝数变异广泛存在,杂合子缺失可能是导致GPC5表达水平降低的原因。
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