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基于城市综合职能评价体系,运用时序全局因子分析方法,文章对海峡西岸经济区城市职能影响因子进行了分析。结果表明：城市综合职能得分较高的依次是福州、温州、厦门、泉州;其中行政中枢、金融贸易、文教卫生福利事业、物流、经济管理、科学技术、社会服务水平是影响海西城市职能发挥的最重要因子,人口规模及义务教育水平次之,工业化水平和城市化水平对海西城市职能的影响较小。最后根据分析结果及海西所处的时代背景,提出了海西城市职能分工合作的建设性意见。