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学科集群和产业集群的协同创新是保障区域经济可持续发展的重中之重。在充分分析学科集群和产业集群协同创新能力重要性的基础上，着重构造双集群协同创新能力评价指标体系，利用OWA算子集结多种权重确定方法实现评价指标的组合赋权，根据协同创新能力评价的不可定量性和不可知性提出利用语言标度与灰度相结合的评价标度进行评价，最后给出一种基于模糊灰度的双集群协同创新能力评价方法，充实了双集群协同创新能力评价理论体系。