【摘 要】
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目的分析云南省手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)患儿标本中柯萨奇病毒A10型(coxsackievirus A10,CV-A10)病毒VP1区基因特征。方法采集2012-2014年云南省HFMD患者
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目的分析云南省手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)患儿标本中柯萨奇病毒A10型(coxsackievirus A10,CV-A10)病毒VP1区基因特征。方法采集2012-2014年云南省HFMD患者粪便和咽拭子标本,用细胞培养法分离病毒,提取病毒RNA,用RT-PCR法进行病毒VP1区基因序列测定,用基因分型方法鉴定病毒的血清型和基因型别。按文献选择CV-A10各基因型的代表株,用MEGA 5.0软件构建CV-A10基因进化树并分析核苷酸和氨基酸的同源性。结果 2012-2014年云南省共采集到21 761份HFMD病例的临床标本,对其中的2 578份标本进行病毒分离,共分离到608株病毒,其中17株为CV-A10。它们之间的核苷酸(nucleotide,nt)和氨基酸(amino acid,aa)同源性分别为94.30%~100.00%和98.04%~100.00%,与原型株(Kowalik,AF081300)的nt和aa同源性为76.23%~76.71%和91.18%~92.65%。基因进化分析表明CV-A10云南分离株为C基因型,它们又分为两个进化分支。结论CV-A10是除EV-A71和CV-A16外引起手足口病的重要病原之一,和国内报道一样,云南省流行的CV-A10为C基因型,2012-2014年有两个进化分支在云南共同流行。
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