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嗜酸乳杆菌是一种很常用的益生菌株之一，具有调节肠道菌群、抑制病原菌、免疫调节、降低血清胆固醇等多种益生功能，广泛应用在食品、医药和饲料等领域。2005年报道第一株嗜酸乳杆菌NCFM的全基因组序列，在基因组水平上揭示了该菌株的部分生理和代谢特征，加速重要功能基因的进一步挖掘，为该菌的筛选和应用打下基础。本文就嘈酸乳杆菌基因组的最新研究进展、重要功能基因和比较基因组进行了综述。