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目的
了解云南省大理地区HCV基因分型及主要流行基因型6n和3a HCV E基因遗传进化和分子特征。
方法2014年1－5月在大理州人民医院收集临床诊断丙型肝炎患者血清；HCV RNA提取，RT-PCR扩增和序列分析。
结果收集到HCV患者血清24份，21份HCV 5UTR基因扩增阳性，其中HCV基因3型15例(3a 4例，3b 11例)和HCV基因6型6例(6k 4例，6n 2例)。2株HCV(10和4)E1/E2基因序列分析结果显示：4与3a型HCV同源性最高，87.98%±3.07和87.97%±2.82，10病毒与6n型HCV同源性最高，90.30±1.87和90.54±1.53；2株病毒E1/E2基因均存在10个潜在糖基化位点；与其他病毒相比，2株病毒仅有5个T细胞抗原表位预测分值发生变化，其余37个抗原表位预测分值变化不大。
结论大理地区目前以基因3型(3a、3b)和基因6型(6k、6n)为主要流行HCV基因型或基因亚型，大理地区流行的3a和6n型HCV的致病性、免疫学等生物学特性未发生明显变化。